В областта на митническото разузнаване и разследване бе повишена ефективността на контролните действия, като за периода бяха задържани, иззети и обезпечени стоки с оценена пряка щета за бюджета близо 21 млн. лева, както и валута и благородни метали на стойност над 5 млн. лева.
Проактивните действия в областта на борбата с контрабандата на цигари бяха верифицирани и от независимото изследване на инициативата "Срещу незаконната търговия", което отчете, че само за година делът на потребяваните в страната нелегални цигари е намалял с 5.3 процентни пункта от 13.4% през второто тримесечие на 2015 г. до 8.1% през същото тримесечие на 2016 г.
През изминалата година Агенция "Митници" е задържала над 43.9 млн. къса нелегални цигари, което е с 47.0% повече в сравнение с предходния период. Агенция "Митници" реализира сериозни задържания на нелегален тютюн за пушене, като за 2016 г. отбелязваме ръст на количествата с 80.0% до 51 722 кг. Този резултат отразява усилията на митническата администрация за ограничаване на нелегалната търговия в една сравнително нова ниша, появила се в отговор на нарастващите цени на тютюневите изделия. 440 000 л са енергийните и над 289 000 л са алкохолните продукти, за които е установено нарушение на акцизното законодателство.
Общото количество наркотични вещества и прекурсори, задържани от Агенция "Митници" през 2016 г. възлиза на над 3 721.655 кг в 99 случая. Наблюдава се нарастване спрямо предходната година, както при задържаните количества (три пъти), така и при броя на случаите ( с 10.0%).
Изминалата година бележи ръст от 40% и при заловените количества хероин (360 кг в 18 случая).
През изминалата година марихуаната беше най-често задържания вид наркотик на границите на страната. Митническите служители предотвратиха 21 опита за нелегален трафик и задържаха общо 636,701 кг марихуана. Това количество е със 17% по-голямо в сравнение със задържаното през 2015 г.
През 2016 г. митническите служители задържаха 57,986 кг кокаин в 15 случая. Нов момент са залавянията на значителни за страната ни количества кокаин, превозвани с товарен сухопътен транспорт от Западна Европа през или за България. Пример за това са задържаните от митническите органи количества на вход в страната на МП Калотина (23 кг) и ГКПП Кулата (26 кг).