Защитената зона "Оризища Цалапица" представлява комплекс от използващи се за оризопроизводство оводнени площи, както и комплекс от влажни ливади. В зоната са установени 46 вида птици, от които 10 са включени в Червената книга на България, а 23 вида имат европейско природозащитно значение. Условията в оризища Цалапица осигуряват подходящи местообитания на още 11 вида птици, за които се изискват специални мерки за защита според Закона за биологичното разнообразие. Оризищата са едно от най-важните гнездови находища на кафявокрилия огърличник и място, концентрирало популацията на жълтокрака чайка в Горнотракийската низина. 

Това определя и приоритетните цели на плана за управление на зоната - опазване и поддържане на местообитанията на защитените птици и възстановяване на местообитанията на тези видове птици, които се нуждаят от по-добри природозащитни мерки.

В резултат на успешната реализация на проекта, включващ и предварителни подробни проучвания и анализ, е разработен План за управление на защитена зона "Оризища Цалапица". В него са идентифицирани и оценени основните заплахи за обитателите на защитената зона и са предложени конкретни мерки и препоръки за предотвратяване на неблагоприятното въздействие върху видовете птици и техните местообитания. За да се осигури интегрираното управление на защитената зона е направено зониране на територията й и са предложени режими на управление за всяка от зоните. 

 
Защитена зона "Оризища Цалапица" е първата зона от мрежата НАТУРА 2000 в България с изработен План за управление, внесен за утвърждаване от Министъра на околната среда и водите. 

Очаква се в резултат от прилагането на плана за управление да се постигне баланс между опазването на консервационно значими видове птици и местообитанията им и извършването на стопански дейности от местното население.