Д-р Ани Егинлиян завършва медицина през 1970 г. във ВМИ-Пловдив, а през 1971 г. постъпва на работа в ХЕИ, Пазарджик. През 1975 г. придобива специалност „Епидемиология". След конкурс през 1979 г. започва работа като ординатор в отдел „Епидемиология" в ХЕИ, Пловдив. От 1993 г. е началник отдел „Противоепидемиологичен контрол". От 2002 г. д-р Егинлиян е директор на Регионалната инспекция за опазване и контрол на общественото здраве, гр. Пловдив.
Д-р Егинлиян има завършена специалност по здравен мениджмънт, преминала е курс на Световна банка за управление на имунизациите и курс по безопасност на храните в Гърция по Европейската програма за безопасност на храните.