Състезанието "Натура 2000" ще се проведе в два кръга - училищен (по места) и финален (в Пловдив), като право на участие имат всички ученици от 7 до 12 клас. Материали за самоподготовка на участниците, указания за провеждане на състезанието и примерни учебни тестове, са изпратени до всички основни, средни и професионални училища на територията на Пловдивска област. Заявки за участие в състезанието ще се подават от училищата до 16 октомври. Материали за самоподготовка на участниците са достъпни за изтегляне и от интернет, в раздела "За студенти и ученици" на страницата на БФБ: www.bbf.biodiversity.bg.
Всеки кръг от състезанието ще включва тест и практически задачи. Писмените работи и в двата кръга ще бъдат проверявани от експерти на фондация "Биоразнообразие" и ще се оценяват по предварително изготвени критерии. За финалния кръг в Пловдив, ще бъдат класирани най-добре представилите се участници от училищния кръг.
Състезанието се реализира по проект, одобрен от Министерство на образованието, младежта и науката и финансиран от Европейския социален фонд, чрез Оперативна програма "Развитие на човешките ресурси", по схемата "Да направим училището привлекателно за младите хора". При първото провеждане на състезанието в Пловдивска област през 2008 година, в него се включиха над 650 ученици от 36 училища и 15 населени места.